Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nlrc4Q3UP24 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nlrc4Q3UP24 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc4Q3UP24 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms