Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmdn3Q3UJU9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rmdn3Q3UJU9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rmdn3Q3UJU9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms