Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 562 ms