Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil3Q3UFQ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil3Q3UFQ8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms