Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srebf2Q3U1N2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms