Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d2bQ3U0J8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2bQ3U0J8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms