Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ87

March9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March9Q3TZ87 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March9Q3TZ87 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
March9Q3TZ87 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
March9Q3TZ87 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March9Q3TZ87 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
March9Q3TZ87 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
March9Q3TZ87 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
March9Q3TZ87 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
March9Q3TZ87 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
March9Q3TZ87 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
March9Q3TZ87 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
March9Q3TZ87 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
March9Q3TZ87 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
March9Q3TZ87 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
March9Q3TZ87 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
March9Q3TZ87 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms