Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pip4p1Q3TWL2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pip4p1Q3TWL2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pip4p1Q3TWL2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms