Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUA9

Pomk, Protein O-mannose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomkQ3TUA9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PomkQ3TUA9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PomkQ3TUA9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PomkQ3TUA9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms