Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd4Q3TT99 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd4Q3TT99 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms