Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc10Q3TLI0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc10Q3TLI0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc10Q3TLI0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms