Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim43aQ3TL54 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim43aQ3TL54 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms