Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDRF1Q3B7T1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDRF1Q3B7T1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms