Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPEL1Q2QD12 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms