Protein–RNA interactions for Protein: Q1HG43

DUOXA1, Dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1Q1HG43 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOXA1Q1HG43 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOXA1Q1HG43 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOXA1Q1HG43 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUOXA1Q1HG43 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOXA1Q1HG43 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms