Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FXNQ16595 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FXNQ16595 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FXNQ16595 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FXNQ16595 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FXNQ16595 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FXNQ16595 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FXNQ16595 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FXNQ16595 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FXNQ16595 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FXNQ16595 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FXNQ16595 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FXNQ16595 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FXNQ16595 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FXNQ16595 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FXNQ16595 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FXNQ16595 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FXNQ16595 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FXNQ16595 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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FXNQ16595 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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FXNQ16595 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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FXNQ16595 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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FXNQ16595 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FXNQ16595 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FXNQ16595 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FXNQ16595 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FXNQ16595 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FXNQ16595 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FXNQ16595 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FXNQ16595 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FXNQ16595 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FXNQ16595 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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FXNQ16595 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FXNQ16595 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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FXNQ16595 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FXNQ16595 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FXNQ16595 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FXNQ16595 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FXNQ16595 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FXNQ16595 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FXNQ16595 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FXNQ16595 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FXNQ16595 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FXNQ16595 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FXNQ16595 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FXNQ16595 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FXNQ16595 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FXNQ16595 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FXNQ16595 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FXNQ16595 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FXNQ16595 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FXNQ16595 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FXNQ16595 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FXNQ16595 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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