Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NFKBIBQ15653 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFKBIBQ15653 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIBQ15653 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms