Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.686e-40■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 DMBX1-202ENST00000371956 2882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.924e-11■■■■■ 33.6
PCBP1Q15365 CFL1-210ENST00000530945 1509 ntTSL 218.28■□□□□ 0.524e-11■■■■■ 33.6
PCBP1Q15365 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.484e-11■■■■■ 33.6
PCBP1Q15365 CFL1-207ENST00000527752 766 ntTSL 513.01□□□□□ -0.334e-11■■■■■ 33.6
PCBP1Q15365 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 33.6
PCBP1Q15365 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 33.6
PCBP1Q15365 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.812e-24■■■■■ 33.5
PCBP1Q15365 ENTPD2-203ENST00000460614 1427 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.746e-10■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.666e-10■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.549e-8■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.219e-8■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.329e-8■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.339e-8■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 L3MBTL1-213ENST00000471977 318 ntTSL 310.9□□□□□ -0.666e-8■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.856e-8■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 L3MBTL1-205ENST00000422861 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.65□□□□□ -0.866e-8■■■■■ 33.4
PCBP1Q15365 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.21e-9■■■■■ 33.3
PCBP1Q15365 PER1-205ENST00000578089 830 ntTSL 313.32□□□□□ -0.284e-9■■■■■ 33.2
PCBP1Q15365 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)27.35■■□□□ 1.973e-7■■■■■ 33.1
PCBP1Q15365 MAPK1IP1L-203ENST00000554364 565 ntTSL 210.2□□□□□ -0.782e-10■■■■■ 33.1
PCBP1Q15365 INPPL1-210ENST00000541303 1238 ntTSL 212.75□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 33.1
PCBP1Q15365 INPPL1-205ENST00000537755 535 ntTSL 412.75□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 33.1
PCBP1Q15365 XYLB-204ENST00000472721 546 ntTSL 414.88□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 XYLB-202ENST00000424034 3484 ntTSL 29.15□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 IFITM3-203ENST00000531688 500 ntTSL 311.6□□□□□ -0.552e-15■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.449e-13■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 EMP3-208ENST00000599255 667 ntTSL 315.43■□□□□ 0.063e-12■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.193e-12■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 EMP3-205ENST00000597057 406 ntTSL 213.09□□□□□ -0.313e-12■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 EMP3-202ENST00000593437 502 ntTSL 511.77□□□□□ -0.533e-12■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 EMP3-206ENST00000597279 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.613e-12■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 EMP3-201ENST00000270221 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.653e-12■■■■■ 32.9
PCBP1Q15365 IDUA-202ENST00000502829 558 ntTSL 230.95■■■□□ 2.558e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.348e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.198e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 RFWD2-207ENST00000474194 975 ntTSL 327.87■■■□□ 2.058e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.058e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 C20orf27-203ENST00000399672 1734 ntAPPRIS P1 TSL 227.76■■■□□ 2.039e-8■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.972e-7■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.968e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.838e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MDK-208ENST00000481047 775 ntTSL 225.69■■□□□ 1.71e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.698e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.668e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.668e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.589e-8■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MTMR14-210ENST00000447144 1664 ntTSL 224.74■■□□□ 1.558e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.558e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SLC10A3-205ENST00000453912 1167 ntTSL 224.7■■□□□ 1.548e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MDK-207ENST00000441869 540 ntTSL 324.55■■□□□ 1.521e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.498e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GATAD2A-210ENST00000457895 729 ntTSL 224.13■■□□□ 1.451e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.455e-14■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.428e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 DCXR-206ENST00000578273 877 ntTSL 523.95■■□□□ 1.421e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.398e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 TFR2-207ENST00000473374 891 ntTSL 523.71■■□□□ 1.398e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.388e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GAK-219ENST00000512325 577 ntTSL 323.44■■□□□ 1.348e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.328e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.328e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 OSBPL5-218ENST00000534454 1731 ntTSL 523.04■■□□□ 1.288e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ICE2-206ENST00000558654 561 ntTSL 423.01■■□□□ 1.278e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 322.63■■□□□ 1.218e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GATAD2A-212ENST00000494516 640 ntTSL 222.52■■□□□ 1.21e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.198e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MDK-212ENST00000533952 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.28■■□□□ 1.161e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GATAD2A-204ENST00000417582 655 ntTSL 222.18■■□□□ 1.141e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GDF11-202ENST00000546799 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.06■■□□□ 1.128e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.19e-8■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.18e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ICE2-212ENST00000561087 545 ntTSL 421.7■■□□□ 1.068e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ICE2-209ENST00000560520 568 ntTSL 421.7■■□□□ 1.068e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 221.6■■□□□ 1.058e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.048e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 421.52■■□□□ 1.048e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 321.48■■□□□ 1.038e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 EPHB4-207ENST00000489808 921 ntTSL 1 (best)21.22■□□□□ 0.991e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.988e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ICE2-217ENST00000561446 564 ntTSL 421.09■□□□□ 0.978e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ICE2-211ENST00000560895 571 ntTSL 421.09■□□□□ 0.978e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.968e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.968e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 RABAC1-203ENST00000596171 759 ntTSL 220.86■□□□□ 0.938e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ABCA2-222ENST00000494046 1622 ntTSL 520.78■□□□□ 0.928e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MDK-210ENST00000490240 603 ntTSL 1 (best)20.66■□□□□ 0.91e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PHF20L1-202ENST00000315808 2226 ntTSL 1 (best)20.61■□□□□ 0.898e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.888e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GATAD2A-213ENST00000609040 1652 ntTSL 220.55■□□□□ 0.881e-10■■■■■ 32.8
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