Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP1BQ14684 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP1BQ14684 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP1BQ14684 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
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