Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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