Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MADCAM1Q13477 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MADCAM1Q13477 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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