Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFIAQ12857 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NFIAQ12857 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NFIAQ12857 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NFIAQ12857 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NFIAQ12857 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NFIAQ12857 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NFIAQ12857 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NFIAQ12857 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFIAQ12857 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFIAQ12857 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFIAQ12857 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NFIAQ12857 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NFIAQ12857 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFIAQ12857 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIAQ12857 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NFIAQ12857 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NFIAQ12857 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NFIAQ12857 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFIAQ12857 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIAQ12857 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIAQ12857 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIAQ12857 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NFIAQ12857 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFIAQ12857 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NFIAQ12857 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NFIAQ12857 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFIAQ12857 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIAQ12857 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NFIAQ12857 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIAQ12857 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIAQ12857 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NFIAQ12857 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NFIAQ12857 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIAQ12857 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIAQ12857 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFIAQ12857 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFIAQ12857 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
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