Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YBL077WYBL077W 432 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 MPP6YNR024W 561 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YOR114WYOR114W 885 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 PNO1YOR145C 825 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YOR289WYOR289W 756 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 UAF30YOR295W 687 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 MRPL37YBR268W 318 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 RGT2YDL138W 2292 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YJL045WYJL045W 1905 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 ART10YLR392C 1557 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 MAD3YJL013C 1548 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 MPE1YKL059C 1326 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 HHY1YEL059W 309 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 SOL3YHR163W 750 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YIR035CYIR035C 765 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 PRM9YAR031W 897 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 CDA1YLR307W 906 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YBL071CYBL071C 309 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 ATP23YNR020C 813 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 ARG1YOL058W 1263 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 IAH1YOR126C 717 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 ATP4YPL078C 735 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 SPC29YPL124W 762 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 FRE5YOR384W 2085 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 UIP5YKR044W 1332 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 RDI1YDL135C 609 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 DAS2YDR020C 699 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YDR157WYDR157W 402 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 TES1YJR019C 1050 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YJR071WYJR071W 369 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 SRY1YKL218C 981 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 EMG1YLR186W 759 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 VPS65YLR322W 315 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YPR078CYPR078C 1119 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 TCB1YOR086C 3561 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 SPO23YBR250W 1572 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 NOP7YGR103W 1818 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 RQC1YDR333C 2172 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 ORC5YNL261W 1440 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 HNM1YGL077C 1692 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YCR085WYCR085W 354 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 CNN1YFR046C 1086 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YGL082WYGL082W 1146 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YGR219WYGR219W 342 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 FOL2YGR267C 732 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 SFH5YJL145W 885 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 MPD1YOR288C 957 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YPR130CYPR130C 408 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 YPR172WYPR172W 603 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-DR3Q12441 LEO1YOR123C 1395 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 YCK1YHR135C 1617 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 SRV2YNL138W 1581 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 YER084W-AYER084W-A 513 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 GLE2YER107C 1098 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 SEH1YGL100W 1050 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 SRB5YGR104C 924 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 NFU1YKL040C 771 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 YKL071WYKL071W 771 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 BOS1YLR078C 735 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 ATP19YOL077W-A 207 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 PET123YOR158W 957 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 MUM2YBR057C 1101 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 KIN1YDR122W 3195 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 CDC3YLR314C 1563 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 RSP5YER125W 2430 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 PPH3YDR075W 927 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 NPA3YJR072C 1158 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 SNO1YMR095C 675 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 SPS19YNL202W 879 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 YPT11YNL304W 1254 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 RER2YBR002C 861 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 PEP4YPL154C 1218 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 YPL205CYPL205C 345 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 PHO3YBR092C 1404 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 SLM5YCR024C 1479 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 COS7YDL248W 1152 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 DON1YDR273W 1098 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 RTA1YGR213C 954 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 LEU5YHR002W 1074 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 COS5YJR161C 1152 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 AUR1YKL004W 1206 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 GAT3YLR013W 426 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 RNA170RNA170 169 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 YOR012WYOR012W 414 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 ADE13YLR359W 1449 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 ECM30YLR436C 3825 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 WSC3YOL105C 1671 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 CAN1YEL063C 1773 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 MRPL1YDR116C 858 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 GTS1YGL181W 1191 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 TDA10YGR205W 873 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 PRS3YHL011C 963 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 YHR180WYHR180W 492 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 THI11YJR156C 1023 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 POM33YLL023C 840 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1A-DR3Q12441 MEU1YLR017W 1014 nt6.55□□□□□ -1.36
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