Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CGNL1Q0VF96 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CGNL1Q0VF96 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms