Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5aQ0V8T9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.4 ms