Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARAQ07869 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms