Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MestQ07646 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MestQ07646 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MestQ07646 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MestQ07646 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MestQ07646 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MestQ07646 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MestQ07646 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MestQ07646 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MestQ07646 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MestQ07646 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MestQ07646 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MestQ07646 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MestQ07646 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MestQ07646 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MestQ07646 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MestQ07646 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MestQ07646 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MestQ07646 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MestQ07646 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MestQ07646 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MestQ07646 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MestQ07646 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MestQ07646 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MestQ07646 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MestQ07646 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MestQ07646 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MestQ07646 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MestQ07646 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MestQ07646 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MestQ07646 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MestQ07646 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MestQ07646 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MestQ07646 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MestQ07646 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MestQ07646 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MestQ07646 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MestQ07646 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MestQ07646 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MestQ07646 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MestQ07646 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MestQ07646 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MestQ07646 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MestQ07646 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MestQ07646 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MestQ07646 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MestQ07646 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MestQ07646 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MestQ07646 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MestQ07646 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MestQ07646 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MestQ07646 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MestQ07646 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms