Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDSPL2Q05D32 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDSPL2Q05D32 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms