Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINDOCQ05AH6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINDOCQ05AH6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPINDOCQ05AH6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINDOCQ05AH6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms