Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 LCB2YDR062W 1686 nt6.39□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YDR124WYDR124W 975 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 SLO1YER180C-A 258 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RPT6YGL048C 1218 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 DYS1YHR068W 1164 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 SFK1YKL051W 1062 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 ELF1YKL160W 438 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RCE1YMR274C 948 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 DOM34YNL001W 1161 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RRT2YBR246W 1164 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RTT106YNL206C 1368 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 GUP2YPL189W 1830 nt6.38□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 PYC2YBR218C 3543 nt6.37□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RRI1YDL216C 1323 nt6.37□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 CIR1YGR207C 786 nt6.37□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 UIP3YAR027W 708 nt6.37□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 GTR1YML121W 933 nt6.37□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YBL070CYBL070C 321 nt6.37□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 ATG29YPL166W 642 nt6.37□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 NMD5YJR132W 3147 nt6.37□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YOR389WYOR389W 1875 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 CYB2YML054C 1776 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 AMD1YML035C 2433 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 GEP7YGL057C 864 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YLR326WYLR326W 723 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 SNO1YMR095C 675 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 ADD37YMR184W 597 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YOR318CYOR318C 306 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 TOS2YGR221C 1869 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RAD7YJR052W 1698 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 CLN2YPL256C 1638 nt6.36□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 GPH1YPR160W 2709 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 MTC1YJL123C 1437 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RPT1YKL145W 1404 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 MLF3YNL074C 1359 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 PAD1YDR538W 729 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 PAN5YHR063C 1140 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YLR366WYLR366W 306 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YOR292CYOR292C 930 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RPL5YPL131W 894 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 SAM4YPL273W 978 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 SMK1YPR054W 1167 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 PRP19YLL036C 1512 nt6.35□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 GSH2YOL049W 1476 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 DBP9YLR276C 1785 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 SRF1YDL133W 1314 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 CUS1YMR240C 1311 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 snR63snR63 255 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 PEX19YDL065C 1029 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 AIM6YDL237W 1173 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RRG1YDR065W 1098 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 CWC21YDR482C 408 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 DCD1YHR144C 939 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YML094C-AYML094C-A 402 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 CSI1YMR025W 888 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 ERG29YMR134W 714 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RPL21AYBR191W 483 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 VTS1YOR359W 1572 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 RIT1YMR283C 1542 nt6.34□□□□□ -1.39
YLR225CQ05948 EFM1YHL039W 1758 nt6.34□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 STL1YDR536W 1710 nt6.33□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 GSH1YJL101C 2037 nt6.33□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 SEC23YPR181C 2307 nt6.33□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.33□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 YHR214WYHR214W 612 nt6.33□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 AIR1YIL079C 1083 nt6.33□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 NTG1YAL015C 1200 nt6.33□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 YAR066WYAR066W 612 nt6.33□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 GUD1YDL238C 1470 nt6.33□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 KIN1YDR122W 3195 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 NUP1YOR098C 3231 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 PIB1YDR313C 861 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 YGL218WYGL218W 651 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 SUI2YJR007W 915 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 HMS2YJR147W 1077 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 CPR6YLR216C 1116 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 ECM15YBL001C 315 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 URA4YLR420W 1095 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 YIM2YMR151W 438 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 GYP8YFL027C 1494 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 UTR2YEL040W 1404 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 COQ6YGR255C 1440 nt6.32□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 CHL4YDR254W 1377 nt6.31□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 STE12YHR084W 2067 nt6.31□□□□□ -1.4
YLR225CQ05948 YDL034WYDL034W 345 nt6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.2 ms