Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNEQ04844 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNEQ04844 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms