Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Epha4Q03137 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Epha4Q03137 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms