Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkczQ02956 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms