Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SP3Q02447 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP3Q02447 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP3Q02447 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SP3Q02447 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP3Q02447 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP3Q02447 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SP3Q02447 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP3Q02447 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP3Q02447 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP3Q02447 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SP3Q02447 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP3Q02447 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP3Q02447 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP3Q02447 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP3Q02447 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SP3Q02447 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP3Q02447 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SP3Q02447 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP3Q02447 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP3Q02447 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP3Q02447 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP3Q02447 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP3Q02447 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SP3Q02447 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SP3Q02447 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SP3Q02447 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP3Q02447 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP3Q02447 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP3Q02447 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP3Q02447 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP3Q02447 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP3Q02447 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP3Q02447 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SP3Q02447 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SP3Q02447 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SP3Q02447 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SP3Q02447 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SP3Q02447 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SP3Q02447 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SP3Q02447 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SP3Q02447 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SP3Q02447 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SP3Q02447 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SP3Q02447 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SP3Q02447 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP3Q02447 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP3Q02447 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP3Q02447 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP3Q02447 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP3Q02447 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SP3Q02447 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SP3Q02447 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SP3Q02447 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SP3Q02447 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SP3Q02447 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SP3Q02447 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SP3Q02447 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SP3Q02447 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP3Q02447 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP3Q02447 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP3Q02447 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP3Q02447 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP3Q02447 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP3Q02447 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP3Q02447 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP3Q02447 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SP3Q02447 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP3Q02447 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms