Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE1BQ01064 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms