Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
EFNB1P98172 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNB1P98172 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms