Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
rp9P97762 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
rp9P97762 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
rp9P97762 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
rp9P97762 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
rp9P97762 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
rp9P97762 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
rp9P97762 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
rp9P97762 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
rp9P97762 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
rp9P97762 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
rp9P97762 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
rp9P97762 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
rp9P97762 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
rp9P97762 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
rp9P97762 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
rp9P97762 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
rp9P97762 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
rp9P97762 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
rp9P97762 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
rp9P97762 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
rp9P97762 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
rp9P97762 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
rp9P97762 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
rp9P97762 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
rp9P97762 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
rp9P97762 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
rp9P97762 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
rp9P97762 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
rp9P97762 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
rp9P97762 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
rp9P97762 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
rp9P97762 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
rp9P97762 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
rp9P97762 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
rp9P97762 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
rp9P97762 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
rp9P97762 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
rp9P97762 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
rp9P97762 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
rp9P97762 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
rp9P97762 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
rp9P97762 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
rp9P97762 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
rp9P97762 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
rp9P97762 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
rp9P97762 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
rp9P97762 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
rp9P97762 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
rp9P97762 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
rp9P97762 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
rp9P97762 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
rp9P97762 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
rp9P97762 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
rp9P97762 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
rp9P97762 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
rp9P97762 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
rp9P97762 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
rp9P97762 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
rp9P97762 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
rp9P97762 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
rp9P97762 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
rp9P97762 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
rp9P97762 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
rp9P97762 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
rp9P97762 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
rp9P97762 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
rp9P97762 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
rp9P97762 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
rp9P97762 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
rp9P97762 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
rp9P97762 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
rp9P97762 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
rp9P97762 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
rp9P97762 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
rp9P97762 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
rp9P97762 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
rp9P97762 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
rp9P97762 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
rp9P97762 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
rp9P97762 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
rp9P97762 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
rp9P97762 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
rp9P97762 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
rp9P97762 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
rp9P97762 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
rp9P97762 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms