Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp2P97473 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms