Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp1P97350 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp1P97350 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms