Protein–RNA interactions for Protein: P97291

Cdh8, Cadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh8P97291 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh8P97291 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh8P97291 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms