Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ElocP83940 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ElocP83940 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ElocP83940 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ElocP83940 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ElocP83940 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ElocP83940 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElocP83940 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElocP83940 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElocP83940 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElocP83940 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ElocP83940 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElocP83940 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElocP83940 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElocP83940 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElocP83940 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ElocP83940 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ElocP83940 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ElocP83940 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ElocP83940 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ElocP83940 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ElocP83940 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ElocP83940 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ElocP83940 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ElocP83940 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ElocP83940 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ElocP83940 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ElocP83940 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ElocP83940 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ElocP83940 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ElocP83940 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ElocP83940 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ElocP83940 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ElocP83940 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ElocP83940 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ElocP83940 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ElocP83940 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ElocP83940 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ElocP83940 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ElocP83940 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ElocP83940 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ElocP83940 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ElocP83940 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ElocP83940 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ElocP83940 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ElocP83940 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ElocP83940 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElocP83940 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElocP83940 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElocP83940 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElocP83940 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ElocP83940 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElocP83940 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElocP83940 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElocP83940 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElocP83940 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElocP83940 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ElocP83940 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ElocP83940 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ElocP83940 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ElocP83940 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ElocP83940 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ElocP83940 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ElocP83940 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ElocP83940 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElocP83940 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElocP83940 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElocP83940 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElocP83940 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElocP83940 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElocP83940 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElocP83940 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElocP83940 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ElocP83940 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ElocP83940 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ElocP83940 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ElocP83940 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ElocP83940 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ElocP83940 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ElocP83940 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ElocP83940 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ElocP83940 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ElocP83940 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ElocP83940 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ElocP83940 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ElocP83940 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ElocP83940 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ElocP83940 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ElocP83940 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1652.8 ms