Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx1P83917 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms