Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFI35P80217 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFI35P80217 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFI35P80217 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFI35P80217 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFI35P80217 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFI35P80217 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFI35P80217 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFI35P80217 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFI35P80217 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFI35P80217 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFI35P80217 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFI35P80217 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFI35P80217 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFI35P80217 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFI35P80217 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFI35P80217 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFI35P80217 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFI35P80217 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFI35P80217 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFI35P80217 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFI35P80217 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFI35P80217 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFI35P80217 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFI35P80217 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFI35P80217 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFI35P80217 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFI35P80217 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFI35P80217 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFI35P80217 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFI35P80217 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFI35P80217 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFI35P80217 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFI35P80217 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFI35P80217 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFI35P80217 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFI35P80217 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFI35P80217 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFI35P80217 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFI35P80217 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFI35P80217 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IFI35P80217 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFI35P80217 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFI35P80217 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFI35P80217 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFI35P80217 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFI35P80217 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFI35P80217 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFI35P80217 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFI35P80217 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFI35P80217 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFI35P80217 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFI35P80217 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFI35P80217 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFI35P80217 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms