Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx1P80205 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otx1P80205 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx1P80205 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx1P80205 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx1P80205 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otx1P80205 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx1P80205 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx1P80205 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms