Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYP4F2P78329 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F2P78329 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms