Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Plxna1P70206 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Plxna1P70206 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156 ms