Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2bP62915 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2bP62915 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2bP62915 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms