Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNRPEP62304 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms