Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSME3P61289 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME3P61289 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME3P61289 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME3P61289 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME3P61289 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME3P61289 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME3P61289 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME3P61289 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME3P61289 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME3P61289 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME3P61289 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME3P61289 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME3P61289 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME3P61289 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSME3P61289 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSME3P61289 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME3P61289 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME3P61289 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME3P61289 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME3P61289 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME3P61289 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSME3P61289 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME3P61289 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSME3P61289 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME3P61289 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME3P61289 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME3P61289 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME3P61289 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME3P61289 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME3P61289 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME3P61289 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME3P61289 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME3P61289 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME3P61289 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME3P61289 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSME3P61289 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME3P61289 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME3P61289 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME3P61289 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME3P61289 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME3P61289 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSME3P61289 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME3P61289 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME3P61289 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME3P61289 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME3P61289 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME3P61289 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME3P61289 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME3P61289 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME3P61289 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME3P61289 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSME3P61289 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME3P61289 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME3P61289 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME3P61289 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME3P61289 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME3P61289 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME3P61289 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME3P61289 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME3P61289 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME3P61289 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms