Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2FP61218 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms